中国药科大学审计处成立于2019年，是学校的内部审计机构，目前共有人员6人。审计处紧紧围绕学校的中心工作，依照国家法律、法规和政策对学校及其下属单位的财务收支及其经济效益实行内部审计监督，独立行使内部审计职权，向学校领导负责并报告工作，同时接受教育部内部审计机构和教育审计协会的业务指导。